・なぜデコンボリューションが必要か?
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・システムのPSF:Point Spread Function(焦点面の上下の画像が写りこむ)が真の画像を歪め
ているため、観察画像にはボケ、ノイズが含まれている
・レンズ、媒体、試料を通過する光情報が屈折率の非接合によりZ軸方向に画像が伸びる
(球面収差) |
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レーザ共焦点顕微鏡像でも |
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・ピンホールを使っているが無限に小さくないので、まだボケが残っている
・3次元的に発生しているフォトンノイズでレーザ共焦点画像(2次元的ボケ取り)でもZ軸方向
にボケが発生している
・ピンホールを小さくすると画像がかすれるので、一般的にはピンホールを理論サイズ
(スキャンスポット)より大きく設定して測定しているのでボケが残る
・ピンホールを開けるとノイズは減るがXY及びZ方向の解像度も悪くする
・ニポウディスク共焦点画像はサイドローブでボケが混入しているのでデコンボリューション
処理をお勧めします。 |
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・デコンボリューションで何が改善されるか? |
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・ボケ取り(ノイズの除去とX,Y,Z解像度の改善)
・褪色補正(2Dタイムラップス画像に有効)
・z軸補正(3Dタイムラップス画像に対して)
・光源ドリフト補正(蛍光顕微鏡画像のみ)
・測定PSFを使用することで球面収差補正(薄いサンプルの正確な補正は難しい)
・コントラストの改善でバックグラウンドとシグナルのコントラストが良くなる
(ボケている画像は本来の輝度値がぼけで散乱しており、これが元の位置に戻されるので
コントラストが良くなる)
**上記改善により定量的な数値解析ができる画像となる**
効果のサンプルについては下記を参照してください。
http://www.svi.nl/gallery/ |
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・正しいデコンボリューションを行うために必要なこと |
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・観察波長、N.A.で計算される十分なX,Y及びZのサンプリングを行う(褪色が心配な場合は、
露光時間を短くしてもサンプリングをナイキストの定理に従う。
ノイズはデコンボリューションで改善されます)
・正しいPSFを作成(理論計算又はビーズ測定)
・デコンボリューション処理に正しいパラメータを設定する
(対物レンズのN.A.,X,Y,Zサンプリングスペース、ピンホール投影サイズ、励起/吸収波長、
オイルインデ ックスなど)
・上下複数枚のスライスを使った3Dデコンボリューションの方がより正確な結果を得る
ことができます。
PSF(Point Spread Function) http://support.svi.nl/wiki/pointspreadfunction
デコンボリューションの実行 http://support.svi.nl/DoingDeconvolution
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・デコンボリューションアルゴリズムとソフトウエアの種類 |
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・Rechardson−Lucy
Micro-Tome (IPLab/Mac OS-Xオプションモジュール,Windowsスタンドアロン)
・Maximum Likelihood Estimation
Huygens (Mac-OSX,Windowsスタンドアロン)
Infocus Advance (IPLab/Winオプションモジュール)
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!!画像の定量的な解析にはデコンボリューションが必要です!! |
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